MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015564	CG	3	6	2480342	2480347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_015564	TGGGTG	2	12	2481193	2481204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015564	TG	3	6	2481203	2481208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015564	CGG	2	6	2481211	2481216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_015564	CCGG	2	8	2481228	2481235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_015564	GT	3	6	2481244	2481249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015564	ACGA	2	8	2482794	2482801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_015564	CAC	2	6	2482809	2482814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_015564	AC	3	6	2482830	2482835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_015564	TTC	2	6	2483402	2483407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_015564	GCC	2	6	2485854	2485859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015564	GCG	2	6	2489713	2489718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015564	TC	3	6	2491535	2491540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_015564	TCCG	2	8	2491542	2491549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_015564	CGAA	3	12	2491745	2491756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_015564	GGC	2	6	2498686	2498691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015564	TCC	2	6	2498701	2498706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_015564	CGC	2	6	2498756	2498761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_015564	ATG	2	6	2500449	2500454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015564	ACG	2	6	2500455	2500460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015564	CCG	2	6	2500522	2500527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_015564	GGC	2	6	2500570	2500575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015564	CGC	2	6	2500606	2500611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_015564	CCT	2	6	2500664	2500669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_015564	CTG	2	6	2500691	2500696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015564	CCACC	2	10	2500737	2500746	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4027	NC_015564	CA	3	6	2500785	2500790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_015564	TG	4	8	2500813	2500820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015564	AGCG	2	8	2500888	2500895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_015564	GC	3	6	2500949	2500954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_015564	GC	3	6	2501003	2501008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_015564	CGGGCA	2	12	2501013	2501024	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_015564	GTAGC	2	10	2501038	2501047	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_015564	CTT	2	6	2503329	2503334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_015564	AGTCGA	2	12	2504345	2504356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4036	NC_015564	CAC	2	6	2504394	2504399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_015564	ACG	2	6	2504402	2504407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015564	AGG	2	6	2504493	2504498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015564	GAG	2	6	2504506	2504511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015564	CTC	2	6	2507092	2507097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_015564	TGC	2	6	2507132	2507137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_015564	TCT	2	6	2510624	2510629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015564	GGC	2	6	2510706	2510711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_015564	ATC	2	6	2511617	2511622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_015564	GGCA	2	8	2514043	2514050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_015564	GCT	2	6	2514105	2514110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015564	TGCGA	2	10	2518557	2518566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4048	NC_015564	ACCC	2	8	2519602	2519609	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4049	NC_015564	GGT	2	6	2519616	2519621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015564	AGG	2	6	2519636	2519641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015564	ATT	2	6	2521847	2521852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015564	AACC	2	8	2523045	2523052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_015564	CCA	2	6	2523103	2523108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_015564	CCG	2	6	2523113	2523118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_015564	TCC	2	6	2523169	2523174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_015564	CGTC	2	8	2529212	2529219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_015564	GGA	2	6	2529290	2529295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015564	GCT	2	6	2530752	2530757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_015564	GAG	2	6	2535010	2535015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015564	CG	4	8	2535033	2535040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_015564	GCG	2	6	2535051	2535056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_015564	AGC	2	6	2543819	2543824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_015564	ATC	2	6	2546335	2546340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_015564	GAG	2	6	2547417	2547422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015564	TC	3	6	2548505	2548510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_015564	CCG	2	6	2548513	2548518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_015564	AGC	2	6	2548550	2548555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015564	CGGT	2	8	2548580	2548587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_015564	GGGT	2	8	2549603	2549610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015564	CGG	2	6	2551707	2551712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015564	GAG	2	6	2551817	2551822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015564	CACCGC	2	12	2554958	2554969	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_015564	CA	4	8	2554972	2554979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_015564	C	6	6	2554989	2554994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4075	NC_015564	CAA	2	6	2556235	2556240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_015564	ATC	2	6	2557061	2557066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015564	GAT	2	6	2557068	2557073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_015564	ACCC	2	8	2557093	2557100	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4079	NC_015564	CGT	2	6	2558056	2558061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_015564	CAA	2	6	2558091	2558096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_015564	TGAAA	2	10	2558104	2558113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015564	TTC	2	6	2567963	2567968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015564	GA	3	6	2567980	2567985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015564	TTCG	2	8	2568971	2568978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_015564	TGC	2	6	2569516	2569521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015564	TGG	2	6	2569892	2569897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015564	TTTAG	2	10	2571468	2571477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015564	TG	3	6	2571589	2571594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_015564	TTG	2	6	2573300	2573305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015564	CGT	2	6	2575122	2575127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015564	GCC	2	6	2575139	2575144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_015564	CA	3	6	2575890	2575895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_015564	CGC	2	6	2575916	2575921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_015564	AGG	2	6	2575999	2576004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015564	AGG	2	6	2577291	2577296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015564	AG	3	6	2577629	2577634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015564	CCT	2	6	2582801	2582806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_015564	GAG	2	6	2582845	2582850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015564	GAGCA	2	10	2583102	2583111	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4100	NC_015564	GGT	3	9	2583154	2583162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015564	TCG	2	6	2583190	2583195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_015564	GGA	2	6	2583218	2583223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015564	TGC	2	6	2585516	2585521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015564	CTC	2	6	2586282	2586287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_015564	TATG	2	8	2586288	2586295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015564	CTG	2	6	2587246	2587251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_015564	CGG	2	6	2587273	2587278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_015564	CGC	2	6	2587285	2587290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_015564	TA	3	6	2589128	2589133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015564	CTC	2	6	2590569	2590574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_015564	CT	3	6	2590593	2590598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_015564	TGCG	2	8	2590652	2590659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_015564	CG	3	6	2590739	2590744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_015564	CCT	2	6	2595989	2595994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_015564	AC	3	6	2596000	2596005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_015564	CG	3	6	2596055	2596060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_015564	GT	3	6	2598059	2598064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015564	GGGT	2	8	2598080	2598087	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015564	CA	3	6	2601675	2601680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_015564	CCG	2	6	2601689	2601694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_015564	AGG	2	6	2605404	2605409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015564	CA	3	6	2605431	2605436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_015564	CCT	2	6	2605734	2605739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_015564	GC	3	6	2605786	2605791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_015564	ATCG	2	8	2605802	2605809	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_015564	TAG	2	6	2608250	2608255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015564	CTA	2	6	2608262	2608267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_015564	GCA	2	6	2609768	2609773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_015564	T	7	7	2613347	2613353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015564	AAC	3	9	2613413	2613421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_015564	CGGT	2	8	2617007	2617014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_015564	ACCG	2	8	2617033	2617040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_015564	GCG	2	6	2617670	2617675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_015564	CCTC	2	8	2617841	2617848	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4135	NC_015564	CG	3	6	2617956	2617961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_015564	CGCC	2	8	2618170	2618177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4137	NC_015564	GCA	2	6	2618327	2618332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4146	NC_015564	GGTG	2	8	2619938	2619945	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_015564	TGC	2	6	2619946	2619951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_015564	ACC	2	6	2685408	2685413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_015564	GA	3	6	2687240	2687245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_015564	AGG	2	6	2688652	2688657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_015564	GAA	2	6	2696589	2696594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_015564	CGA	2	6	2697918	2697923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4257	NC_015564	GAC	2	6	2699330	2699335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_015564	TTCA	2	8	2699391	2699398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4259	NC_015564	AGT	2	6	2699413	2699418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_015564	CCT	2	6	2704043	2704048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4261	NC_015564	CAC	2	6	2704061	2704066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4263	NC_015564	ATAC	2	8	2704168	2704175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4264	NC_015564	CAC	2	6	2704188	2704193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4265	NC_015564	CT	3	6	2706611	2706616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4266	NC_015564	C	6	6	2709323	2709328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4294	NC_015564	TGG	2	6	2732206	2732211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4344	NC_015564	ACGG	2	8	2766712	2766719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4373	NC_015564	TCCG	2	8	2785691	2785698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4393	NC_015564	GCA	2	6	2811726	2811731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4394	NC_015564	TGC	2	6	2813660	2813665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_015564	GGC	2	6	2813696	2813701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_015564	TCT	2	6	2815407	2815412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4397	NC_015564	TCGT	2	8	2815423	2815430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4398	NC_015564	AGT	2	6	2820159	2820164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_015564	TCAC	2	8	2820786	2820793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4402	NC_015564	TA	3	6	2820798	2820803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_015564	GCGT	2	8	2820871	2820878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4416	NC_015564	CGCCC	2	10	2837456	2837465	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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4422	NC_015564	GCTG	2	8	2842028	2842035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4424	NC_015564	GAC	2	6	2842133	2842138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4426	NC_015564	TGC	2	6	2842991	2842996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4428	NC_015564	AG	3	6	2848971	2848976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4434	NC_015564	TCG	2	6	2854852	2854857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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